Giao dịch liên kết với công ty mẹ nước ngoài có cần lập hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết?

Giao dịch liên kết với công ty mẹ nước ngoài có cần lập hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết là vướng mắc pháp lý mà nhiều doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài (FDI) đang đối mặt khi thực hiện nghĩa vụ thuế. Bài viết dưới đây sẽ phân tích chi tiết các quy định hiện hành, cùng ACAA GLOBAL đi sâu vào từng khía cạnh pháp lý để bạn đọc có cái nhìn toàn diện và chính xác nhất.

Mục lục

1. Giao dịch liên kết với công ty mẹ nước ngoài có cần lập hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết?

Theo quy định tại Nghị định 20/2025/NĐ-CP, câu trả lời ngắn gọn là CÓ, nhưng không phải trong mọi trường hợp. Việc lập hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết là một nghĩa vụ bắt buộc đối với người nộp thuế có phát sinh giao dịch liên kết, trừ một số trường hợp được miễn trừ theo quy định.

Cụ thể, Nghị định 20/2025/NĐ-CP quy định về các trường hợp được miễn lập hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết. Theo đó, người nộp thuế chỉ được miễn lập hồ sơ khi đáp ứng đồng thời các điều kiện sau:

Có phát sinh giao dịch liên kết nhưng tổng doanh thu phát sinh của kỳ tính thuế dưới 50 tỷ đồng và tổng giá trị giao dịch liên kết phát sinh dưới 30 tỷ đồng.
Đã thực hiện đầy đủ nghĩa vụ kê khai, xác định giá giao dịch liên kết.
Không thuộc trường hợp được miễn kê khai xác định giá giao dịch liên kết.

Như vậy, nếu doanh nghiệp có giao dịch liên kết với công ty mẹ nước ngoài và không thuộc các trường hợp miễn trừ nêu trên, doanh nghiệp bắt buộc phải lập hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết. Việc không lập hồ sơ khi thuộc đối tượng phải lập sẽ bị xử phạt vi phạm hành chính về thuế theo quy định tại Luật Quản lý thuế 2025.

2. Các trường hợp được miễn lập hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết

Để giúp doanh nghiệp xác định chính xác nghĩa vụ của mình, cần phân tích chi tiết các trường hợp được miễn lập hồ sơ. Theo quy định tại Nghị định 20/2025/NĐ-CP, người nộp thuế được miễn lập hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết nếu thuộc một trong các trường hợp sau:

Người nộp thuế có phát sinh giao dịch liên kết nhưng tổng doanh thu phát sinh của kỳ tính thuế dưới 50 tỷ đồng và tổng giá trị giao dịch liên kết phát sinh dưới 30 tỷ đồng, đồng thời đã thực hiện đầy đủ nghĩa vụ kê khai, xác định giá giao dịch liên kết theo quy định.
Người nộp thuế kê khai, xác định giá giao dịch liên kết theo giá thị trường nhưng không phát sinh doanh thu trong kỳ tính thuế.
Người nộp thuế có giao dịch liên kết với các bên liên kết nhưng các bên liên kết này có cùng mức thuế suất thuế thu nhập doanh nghiệp và không có sự chênh lệch về ưu đãi thuế, không có bên nào được hưởng ưu đãi thuế trong kỳ tính thuế.

Điều quan trọng cần lưu ý là việc miễn lập hồ sơ không đồng nghĩa với việc miễn kê khai. Doanh nghiệp vẫn phải thực hiện nghĩa vụ kê khai xác định giá giao dịch liên kết theo mẫu biểu quy định tại Phụ lục ban hành kèm theo Nghị định 20/2025/NĐ-CP.

Xem thêm: Thủ tục chấm dứt dự án đầu tư nước ngoài tại Việt Nam đúng quy định

3. Hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết gồm những tài liệu gì?

Khi thuộc đối tượng phải lập hồ sơ, doanh nghiệp cần chuẩn bị một bộ hồ sơ đầy đủ và chi tiết. Theo quy định tại Nghị định 20/2025/NĐ-CP, hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết bao gồm các tài liệu sau:

Hồ sơ thông tin về người nộp thuế và các bên liên kết: Bao gồm thông tin về mối quan hệ liên kết, cơ cấu tổ chức, lĩnh vực hoạt động, chức năng hoạt động, tài sản và rủi ro của từng bên liên kết.
Hồ sơ thông tin về giao dịch liên kết: Mô tả chi tiết từng loại giao dịch liên kết phát sinh, bao gồm giá trị, điều kiện thanh toán, thời hạn thanh toán, các điều khoản hợp đồng và các thông tin liên quan khác.
Hồ sơ phân tích so sánh độc lập: Bao gồm các tài liệu về việc lựa chọn phương pháp xác định giá giao dịch liên kết, các giao dịch so sánh độc lập được lựa chọn, các điều chỉnh khác biệt trọng yếu và kết quả phân tích.
Hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết: Trình bày chi tiết về việc áp dụng phương pháp xác định giá, các giả định quan trọng, nguồn dữ liệu sử dụng và kết quả xác định giá giao dịch liên kết.

Ngoài ra, doanh nghiệp cần lưu ý rằng hồ sơ phải được lập bằng tiếng Việt. Trong trường hợp sử dụng tài liệu bằng tiếng nước ngoài, doanh nghiệp phải dịch sang tiếng Việt và chịu trách nhiệm về tính chính xác của bản dịch.

Xem thêm: Hồ sơ đăng ký giao dịch ngoại hối đầu tư ra nước ngoài chi tiết

4. Quy trình lập và nộp hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết

Việc lập và nộp hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết cần được thực hiện theo một quy trình cụ thể. Dưới đây là các bước cơ bản mà doanh nghiệp cần tuân thủ:

Bước 1: Xác định đối tượng và phạm vi giao dịch liên kết

Doanh nghiệp cần rà soát toàn bộ các giao dịch phát sinh với công ty mẹ nước ngoài và các bên liên kết khác để xác định đâu là giao dịch liên kết theo quy định tại Nghị định 20/2025/NĐ-CP. Việc xác định chính xác phạm vi giao dịch liên kết là tiền đề quan trọng để lập hồ sơ đúng và đầy đủ.

Bước 2: Thu thập và phân tích dữ liệu so sánh

Doanh nghiệp tiến hành thu thập dữ liệu từ các nguồn đáng tin cậy như cơ sở dữ liệu của Tổng cục Thuế, các cơ sở dữ liệu thương mại trong và ngoài nước để tìm kiếm các giao dịch độc lập tương đương. Sau đó, doanh nghiệp thực hiện phân tích, điều chỉnh các khác biệt trọng yếu để lựa chọn các giao dịch so sánh phù hợp nhất.

Bước 3: Lựa chọn phương pháp xác định giá và lập hồ sơ

Căn cứ vào đặc điểm cụ thể của từng loại giao dịch liên kết, doanh nghiệp lựa chọn một trong các phương pháp quy định tại Nghị định 20/2025/NĐ-CP như phương pháp giá so sánh độc lập, phương pháp giá bán lại, phương pháp chi phí cộng lãi, phương pháp tỷ lệ lợi nhuận thuần hoặc phương pháp phân bổ lợi nhuận. Sau khi lựa chọn phương pháp, doanh nghiệp tiến hành lập bộ hồ sơ hoàn chỉnh theo quy định.

Bước 4: Nộp hồ sơ và kê khai thông tin

Hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết phải được lưu trữ tại trụ sở chính của doanh nghiệp và xuất trình khi cơ quan thuế có yêu cầu. Đồng thời, doanh nghiệp phải thực hiện kê khai thông tin về quan hệ liên kết và giao dịch liên kết theo mẫu số 01, 02, 03 ban hành kèm theo Nghị định 20/2025/NĐ-CP khi nộp hồ sơ quyết toán thuế thu nhập doanh nghiệp năm.

5. Câu hỏi thường gặp

Thời hạn nộp hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết là khi nào?

Theo quy định tại Luật Quản lý thuế 2025 và Nghị định 20/2025/NĐ-CP, hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết không phải nộp cùng với hồ sơ khai thuế mà được lưu trữ tại doanh nghiệp.

Doanh nghiệp bị xử phạt như thế nào nếu không lập hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết?

Việc không lập hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết khi thuộc đối tượng phải lập sẽ bị xử phạt vi phạm hành chính về thuế theo quy định tại Luật Quản lý thuế 2025. Mức phạt cụ thể phụ thuộc vào tính chất, mức độ vi phạm và có thể lên đến hàng trăm triệu đồng.